Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVW-1Q9UQF0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms