Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms