Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms