Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNA1Q9UIW2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms