Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms