Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms