Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms