Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms