Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf109Q9NX04 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms