Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms