Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX1Q9NSU2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms