Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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