Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms