Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms