Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms