Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms