Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF17Q9BXT8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms