Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms