Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms