Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFT27Q9BW83 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms