Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPKQ9BS16 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPKQ9BS16 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPKQ9BS16 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPKQ9BS16 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPKQ9BS16 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPKQ9BS16 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPKQ9BS16 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPKQ9BS16 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPKQ9BS16 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPKQ9BS16 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPKQ9BS16 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPKQ9BS16 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms