Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms