Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms