Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms