Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms