Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf47Q8NEP4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms