Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms