Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms