Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms