Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PBRM1Q86U86 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms