Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
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SNX20Q7Z614 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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SNX20Q7Z614 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SNX20Q7Z614 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SNX20Q7Z614 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SNX20Q7Z614 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SNX20Q7Z614 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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