Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HECW1Q76N89 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms