Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms