Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms