Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms