Protein–RNA interactions for Protein: Q6IN84

MRM1, rRNA methyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRM1Q6IN84 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRM1Q6IN84 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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