Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225Q6GV28 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms