Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM46CQ5VWP2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms