Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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C9orf135Q5VTT2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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