Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC38Q5VT99 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 292.6 ms