Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNT1Q5JUK3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms