Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF8

HSP90AB2P, Putative heat shock protein HSP 90-beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB2PQ58FF8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB2PQ58FF8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms