Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms