Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIN52Q52LA3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN52Q52LA3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms