Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms