Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms