Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM86FP-201ENST00000338711 969 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 CRYAB-213ENST00000533475 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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