Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC142Q17RM4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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