Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HADHQ16836 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HADHQ16836 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HADHQ16836 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HADHQ16836 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms