Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
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RTN1Q16799 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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RTN1Q16799 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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